上海藥物所解析人源葡萄糖依賴性促胰島素釋放多肽受體三維結(jié)構(gòu)
近期,中國(guó)科學(xué)院上海藥物研究所王明偉、楊德華團(tuán)隊(duì)攜手徐華強(qiáng)團(tuán)隊(duì)在eLife上,發(fā)表了題為Structural insights into hormone recognition by the human glucose-dependent insulinotropic polypeptide receptor的研究論文。該研究報(bào)道了人源GIPR與GIP1-42和Gs蛋白復(fù)合物的高分辨率冷凍電鏡結(jié)構(gòu),揭示了GIPR的配體識(shí)別和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的分子機(jī)制,從而完成了與血糖調(diào)節(jié)密切相關(guān)的三個(gè)受體——胰高血糖素受體(2013)、胰高血糖素樣肽-1受體(2017)和GIPR三維結(jié)構(gòu)的全解析,深化了學(xué)界對(duì)其在配體識(shí)別、受體激活和交叉反應(yīng)等方面異同性的認(rèn)識(shí),為基于多重藥理學(xué)的藥物發(fā)現(xiàn)提供了結(jié)構(gòu)信息。
為了增強(qiáng)GIPR與Gs蛋白形成的復(fù)合物之穩(wěn)定性,研究人員采用NanoBiT系連技術(shù),分別在GIPR和Gs蛋白上引入LgBiT和HiBiT(Peptide 86)以增加蛋白之間的相互作用,同時(shí)對(duì)受體進(jìn)行單點(diǎn)突變以提高復(fù)合物的穩(wěn)定性,反復(fù)優(yōu)化實(shí)驗(yàn)條件后,獲得了顆粒均一且性狀穩(wěn)定的高質(zhì)量蛋白復(fù)合物,通過(guò)在上海藥物所冷凍電鏡平臺(tái)進(jìn)行多輪300 kV數(shù)據(jù)的收集和處理后,最終獲得分辨率為2.9?的三維結(jié)構(gòu)(圖1)。該結(jié)構(gòu)顯示,GIP1-42的N端插入到GIPR的跨膜域(Transmembrane domain, TMD)中,配體的C端則與胞外環(huán)1(Extracellular loop 1, ECL1)緊密相連。GIPR的ECL1與TM2和3一致向上,然后向內(nèi)接近其TMD的中心(5-7?),使得GIP1-42較之胰高血糖素樣肽-1和胰高血糖素對(duì)應(yīng)其各自受體向TM1分別位移了2.7?和3.3?。定點(diǎn)突變等實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了GIPR獨(dú)特的配體識(shí)別和受體激活機(jī)制,拓展了對(duì)B1類G蛋白偶聯(lián)受體結(jié)構(gòu)與功能的理解。
對(duì)比胰高血糖素受體、胰高血糖素樣肽-1受體和GIPR的配體識(shí)別模式,研究人員發(fā)現(xiàn),這三個(gè)受體均具有與配體共性區(qū)域結(jié)合的保守氨基酸殘基,其與各自內(nèi)源性配體特異性識(shí)別主要依賴配體與受體上非保守殘基的選擇性結(jié)合。具體來(lái)說(shuō),基于序列相似性將多肽可分為四個(gè)片段:兩個(gè)保守的片段域(GIP1-42中第4-11和21-30位氨基酸)和兩個(gè)獨(dú)特的片段域(GIP1-42中第1-3和12-20位氨基酸)(圖2)。配體的N端(第1-3位氨基酸)與B1類受體的極性中心產(chǎn)生大量相互作用,例如,與Q3.37b具有氫鍵相互作用;Y1.47b與多肽的第三位氨基酸形成氫鍵(圖2);多肽上第4-11位氨基酸與R7.35b形成鹽橋,與Y1.43bII-II重疊,與L2.71b、W5.36b和L7.39b形成疏水相互作用,以及和ECL2形成氫鍵等(圖2);多肽上第12-20位氨基酸序列則差別較大,主要與ECL1、ECL2和TM1以及TM2相互作用(圖2)。受體為了能夠合理地結(jié)合不同長(zhǎng)度的氨基酸側(cè)鏈,其TM1和ECL1會(huì)調(diào)整它們的構(gòu)象以避免引起混亂,影響配體結(jié)合。胰高血糖素樣肽-1受體的ECL1與胰高血糖素樣肽-1之距離相比GIPR的ECL1與GIP1-42的距離更遠(yuǎn)。然而,對(duì)胰高血糖素受體來(lái)說(shuō),胰高血糖素上的R18P(P代表多肽上的氨基酸)則排斥其受體。因此,受體特異性結(jié)合配體的區(qū)域可能就位于此,使得胰高血糖素樣肽-1和胰高血糖素均難以結(jié)合GIPR。至于配體的C端,三種多肽均與胞外域產(chǎn)生廣泛的疏水相互作用(圖2)。
研究工作獲得國(guó)家自然科學(xué)基金委員會(huì)、國(guó)家衛(wèi)生健康委員會(huì)、科學(xué)技術(shù)部和上海市科學(xué)技術(shù)委員會(huì)等的資助。
圖1.GIP1-42結(jié)合的GIPR與Gs蛋白復(fù)合物的冷凍電鏡結(jié)構(gòu)。(左)GIP1-42-GIPR-Gs復(fù)合物結(jié)構(gòu);(右)GIPR結(jié)合其內(nèi)源性多肽配體的細(xì)節(jié)圖
圖2.GIPR、胰高血糖素樣肽-1受體(GLP-1R)和胰高血糖素受體(GCGR)的配體選擇特異性
(責(zé)任編輯:劉思慧)
右鍵點(diǎn)擊另存二維碼!
互聯(lián)網(wǎng)新聞信息服務(wù)許可證10120170033
網(wǎng)絡(luò)出版服務(wù)許可證(京)字082號(hào)
?京公網(wǎng)安備 11010802023089號(hào) 京ICP備17013160號(hào)-1