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技術(shù)升級(jí)賦能產(chǎn)品研發(fā) AI助力中國(guó)制藥創(chuàng)新發(fā)展

  • 2024-04-30 11:26
  • 作者:何婉怡
  • 來源:中國(guó)醫(yī)藥報(bào)

生物醫(yī)藥行業(yè)長(zhǎng)期以來面臨新藥研發(fā)周期長(zhǎng)、成本高、成功率低的挑戰(zhàn)。人工智能可對(duì)大量現(xiàn)有的藥物數(shù)據(jù)進(jìn)行深度學(xué)習(xí),以此分析藥物的化學(xué)性質(zhì)和生物活性,更快地設(shè)計(jì)新藥物,預(yù)測(cè)藥物的吸收、代謝和毒性等復(fù)雜過程,從而縮短藥物研發(fā)時(shí)間。


中國(guó)AI制藥雖然起步較晚,但發(fā)展勢(shì)頭強(qiáng)勁,在國(guó)家政策利好、人工智能技術(shù)升級(jí)等因素的推動(dòng)下,有望實(shí)現(xiàn)市場(chǎng)規(guī)模快速增長(zhǎng)。


賦能藥物研發(fā)多個(gè)環(huán)節(jié)

優(yōu)勢(shì)明顯


AI制藥是指將自然語(yǔ)言處理(NLP)、機(jī)器學(xué)習(xí)(ML)及大數(shù)據(jù)(Big Data)等人工智能技術(shù)應(yīng)用到制藥領(lǐng)域各環(huán)節(jié),以提高、優(yōu)化新藥研發(fā)的效率及質(zhì)量,降低臨床試驗(yàn)失敗概率及研發(fā)成本。


傳統(tǒng)制藥的一般流程為藥物靶點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)和驗(yàn)證、藥物設(shè)計(jì)、化合物合成篩選、臨床前研究、臨床試驗(yàn)、審批和上市等步驟。在新藥研發(fā)過程中,通常會(huì)對(duì)5000~10000個(gè)化合物進(jìn)行篩選,約5個(gè)藥物會(huì)進(jìn)入臨床試驗(yàn)階段,最終約1個(gè)藥物有機(jī)會(huì)進(jìn)入審批環(huán)節(jié)并上市,成功率僅有0.01%。根據(jù)公開數(shù)據(jù),傳統(tǒng)制藥研發(fā)一款新藥平均研發(fā)成本為10億~20億美元,平均周期超過10年。可見,傳統(tǒng)的新藥研發(fā)存在周期長(zhǎng)、投資大、風(fēng)險(xiǎn)高等挑戰(zhàn)。


近年來,隨著基因組測(cè)序工程的快速進(jìn)展、二代測(cè)序技術(shù)的快速普及、人工智能技術(shù)的進(jìn)步和高性能計(jì)算機(jī)的發(fā)展,AI制藥應(yīng)運(yùn)而生,發(fā)展迅速。從制藥流程來看,AI技術(shù)已滲透到包括靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)、化合物合成和篩選、晶型預(yù)測(cè)、機(jī)制探索、選擇受試人群、藥物警戒等多個(gè)環(huán)節(jié)。相較于傳統(tǒng)藥物研發(fā),AI技術(shù)能將藥物發(fā)現(xiàn)、臨床前研究的時(shí)間縮短近40%,新藥研發(fā)成功率可從12%提高到約14%。中國(guó)AI制藥企業(yè)在藥物發(fā)現(xiàn)階段的應(yīng)用布局涉及虛擬篩選、分子生成等領(lǐng)域。(詳見圖1)


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政策支持

中國(guó)AI制藥迎來高速成長(zhǎng)期


《“十四五”醫(yī)藥工業(yè)發(fā)展規(guī)劃》指出,以新一代信息技術(shù)賦能醫(yī)藥研發(fā),探索人工智能、云計(jì)算、大數(shù)據(jù)等技術(shù)在研發(fā)領(lǐng)域的應(yīng)用,通過對(duì)生物學(xué)數(shù)據(jù)挖掘分析、模擬計(jì)算,提升新靶點(diǎn)和新藥物的發(fā)現(xiàn)效率;在實(shí)驗(yàn)動(dòng)物模型構(gòu)建、藥物設(shè)計(jì)、藥理藥效研究、臨床試驗(yàn)、數(shù)據(jù)分析等環(huán)節(jié)加強(qiáng)信息技術(shù)應(yīng)用,縮短研發(fā)周期、降低研發(fā)成本。


政策的推出有利于推進(jìn)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)的開發(fā)應(yīng)用和整合共享,探索建立統(tǒng)一的臨床大數(shù)據(jù)平臺(tái),為創(chuàng)新藥研發(fā)及臨床研究提供有力的支撐,進(jìn)一步促進(jìn)了中國(guó)醫(yī)藥工業(yè)高端化、智能化和綠色化發(fā)展。


截至2023年年底,中國(guó)AI制藥企業(yè)已超過90家,包括騰邁醫(yī)藥、英矽智能、晶泰科技、深勢(shì)科技等,這些企業(yè)覆蓋藥物研發(fā)的六大環(huán)節(jié),包括早期藥物開發(fā)、數(shù)據(jù)處理、臨床開發(fā)、端到端藥物開發(fā)、臨床前開發(fā)及藥物再利用。從開發(fā)藥物的


適應(yīng)證來看,主要集中在腫瘤、免疫學(xué)及神經(jīng)病學(xué)等領(lǐng)域。


生成式AI實(shí)現(xiàn)藥物從頭設(shè)計(jì)技術(shù)進(jìn)步顯著提升研發(fā)效率


20世紀(jì)90年代初,基礎(chǔ)AI研究取得突破,推動(dòng)近30年來的各種實(shí)際應(yīng)用,如ImageNet、GANs、Transformer及其他先進(jìn)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)。人工智能應(yīng)用于藥物發(fā)現(xiàn)的可能性引發(fā)各界關(guān)注。


在早期階段,AI制藥主要集中在擴(kuò)大化合物篩選和優(yōu)化藥物研發(fā)流程上。例如一些初創(chuàng)公司開始利用卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)等技術(shù)進(jìn)行藥物發(fā)現(xiàn),通過訓(xùn)練大量的生物數(shù)據(jù)來提高新藥研發(fā)的成功率。直至2020年,英國(guó)Exscientia公司開發(fā)的藥物DSP-1181作為全球第一個(gè)由AI設(shè)計(jì)的分子進(jìn)入臨床試驗(yàn)階段,標(biāo)志著AI制藥開始進(jìn)入實(shí)際應(yīng)用階段,這推動(dòng)了AI制藥熱興起,2020年成為AI制藥爆發(fā)元年。


生成式AI通過從頭設(shè)計(jì),顯著提升藥物研發(fā)效率。生成式AI在藥物發(fā)現(xiàn)中能預(yù)測(cè)候選藥物的元素(如原子、鍵的類型等),并為特定目標(biāo)生成化學(xué)實(shí)體,由此推動(dòng)藥物發(fā)現(xiàn)和臨床前研究階段由4~6年縮短至1~3年。


2023年Chat GPT的爆火,進(jìn)一步提升AI制藥領(lǐng)域的熱度,如英矽智能在生成化學(xué)領(lǐng)域知名期刊Chemical Science發(fā)表文章,闡述了分子生成平臺(tái)Chemistry42在AIphaFold2蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的基礎(chǔ)上進(jìn)行分子設(shè)計(jì),進(jìn)而在30天內(nèi)發(fā)現(xiàn)靶向潛在抗癌靶點(diǎn)CDK20的小分子抑制劑的過程,展示了在有限分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)下,人工智能可以輔助新藥物發(fā)現(xiàn),實(shí)現(xiàn)降本增效。


目前,中國(guó)多家醫(yī)藥企業(yè)和CRO公司已布局AI+新藥研發(fā)的相關(guān)領(lǐng)域,隨著應(yīng)用的不斷成熟和落地,預(yù)計(jì)將顯著提升藥物研發(fā)效率,助力藥物發(fā)現(xiàn)。(詳見圖2)


4B0


技術(shù)革新推動(dòng)細(xì)分行業(yè)應(yīng)用落地

市場(chǎng)體量快速增長(zhǎng)


據(jù)頭豹研究院數(shù)據(jù),2019—2023年,中國(guó)AI制藥市場(chǎng)規(guī)模由7000萬元增加至4.1億元,年復(fù)合增速達(dá)57.4%。預(yù)計(jì)2024—2028年,市場(chǎng)規(guī)模將由7.3億元增加至58.6億元,年復(fù)合增速達(dá)68.5%。(詳見圖3)


E02E


AI技術(shù)在新型療法中的應(yīng)用迅速增加,更為成熟的應(yīng)用有望實(shí)現(xiàn)商業(yè)化,驅(qū)動(dòng)行業(yè)發(fā)展。小分子藥物處于AI在藥物發(fā)現(xiàn)應(yīng)用中的領(lǐng)先地位,賦能包括模擬小分子-靶標(biāo)相互作用、先導(dǎo)候選物優(yōu)化和安全性預(yù)測(cè)等多個(gè)環(huán)節(jié),應(yīng)用較為成熟。


隨著AI技術(shù)和包括RNAi、CRISPR-Cas9、CAR-T和重組DNA等平臺(tái)技術(shù)的迭代,未來3~5年,或?qū)⒂惺卓預(yù)I驅(qū)動(dòng)設(shè)計(jì)的藥物獲批上市,并有大批管線進(jìn)入有效性概念驗(yàn)證階段,推動(dòng)市場(chǎng)進(jìn)一步擴(kuò)容。


更為強(qiáng)大的整合工具產(chǎn)生

激勵(lì)人工智能與多學(xué)科交叉發(fā)展


2020年年底,谷歌旗下公司DeepMind推出的AlphaFold2改變了人們對(duì)蛋白質(zhì)及其相互作用的理解方式,極大地激勵(lì)了人工智能和藥物化學(xué)、結(jié)構(gòu)生物學(xué)等學(xué)科的交叉發(fā)展,為分子表征提供了更好的方法、對(duì)接方法及評(píng)分函數(shù)等。由此,人工智能技術(shù)與蛋白組學(xué)、核酸藥物、細(xì)胞療法和基因療法、微生物組學(xué)等新興技術(shù)和療法的結(jié)合廣受關(guān)注,人工智能通過探索巨大的序列空間和結(jié)構(gòu)空間,包括設(shè)計(jì)自然界中不存在的蛋白質(zhì),為相關(guān)新型療法藥物帶來新的可能。


2023年10月,Deepmind聯(lián)合Isomorphic Labs共同發(fā)布了新一代AlphaFold模型,有望改變藥物發(fā)現(xiàn)的游戲規(guī)則。新一代AlphaFold可以預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)(PDB)中幾乎任何分子的結(jié)構(gòu),通常具有原子精度,包括配體(小分子)、蛋白質(zhì)、核酸(DNA和RNA)以及含有翻譯后修飾(PTM)的生物分子。該模型的擴(kuò)展功能和性能有助于加速生物醫(yī)學(xué)的突破,為疾病通路、基因組學(xué)、潛在治療靶點(diǎn)、藥物設(shè)計(jì)機(jī)制以及實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)工程和合成生物學(xué)的新平臺(tái)的功能提供新的解決思路。


AI加持

臨床管線增長(zhǎng)迎來爆發(fā)期


截至2023年11月,全球處于臨床試驗(yàn)階段且保持活躍狀態(tài)的AI參與研發(fā)的藥物管線總計(jì)97項(xiàng),超過一半的管線處于Ⅰ期臨床試驗(yàn)階段,超過1/3的管線處于Ⅱ期臨床試驗(yàn)階段。


從市場(chǎng)分布來看,有67項(xiàng)來自國(guó)外,占比69.1%;30項(xiàng)來自國(guó)內(nèi),占比30.9%。其中,英矽智能、冰洲石科技、未知君、埃格林醫(yī)藥、藥物牧場(chǎng)、銳格醫(yī)藥等企業(yè)均有多條管線同時(shí)進(jìn)行臨床試驗(yàn),推動(dòng)中國(guó)AI制藥進(jìn)入全球領(lǐng)先隊(duì)列。


從研發(fā)模式來看,自研新藥是AI企業(yè)研制新藥的主要模式,85.6%的管線為企業(yè)自研管線,14.4%的管線為合作研發(fā)管線,多為生命科學(xué)類AI企業(yè)協(xié)助大型藥企進(jìn)行研發(fā)。


從適應(yīng)證分布來看,近50%管線聚焦于腫瘤,占主導(dǎo)地位;神經(jīng)系統(tǒng)疾病位列第二,占比約23%。腫瘤與神經(jīng)系統(tǒng)疾病也是目前藥物研發(fā)難度高、研發(fā)需求又最為強(qiáng)烈的病癥之一。


各大藥企在AI制藥合作項(xiàng)目上,聚焦的病種廣泛分布在抗腫瘤、呼吸系統(tǒng)、抗感染等多個(gè)領(lǐng)域,其中大型藥企在癌癥和精神疾病領(lǐng)域的合作項(xiàng)目占比最高,均為27.9%,其次為心血管疾病,占比13.1%。(詳見圖4)


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跨國(guó)藥企也在內(nèi)部和外部的建設(shè)中進(jìn)一步使用人工智能。例如,強(qiáng)生聘用超過6000名數(shù)據(jù)科學(xué)和計(jì)算科學(xué)專家;阿斯利康曾經(jīng)提到,公司50%的小分子開發(fā)項(xiàng)目目前使用AI輔助。


近年來,中國(guó)城市慢性病的死亡率呈上升趨勢(shì),由于龐大的人口基數(shù)及老齡化的加劇,中國(guó)的慢性病領(lǐng)域的潛在市場(chǎng)空間不斷增長(zhǎng),對(duì)于國(guó)產(chǎn)慢性病創(chuàng)新藥的需求緊迫,或?qū)⒊蔀榭鼓[瘤之外的另一研發(fā)重點(diǎn)。


未來,隨著AI應(yīng)用成熟度的提升,AI技術(shù)在制藥領(lǐng)域的滲透率將不斷提高,成為創(chuàng)新藥研發(fā)的主流方式。


(作者:頭豹研究院 何婉怡)


   


(責(zé)任編輯:陸悅)

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